Arsip untuk ‘Metabolit sekunder’ Kategori

METABOLIT SEKUNDER POLIAMINA PADA TUMBUHAN

Muhammad Hatta

 

Pendahuluan

Tumbuhan secara alamiah menghasilkan beragam jenis senyawa. Secara umum, senyawa-senyawa tersebut dapat dibagi tiga, yaitu metabolit primer, polimer, dan metabolit sekunder. Metabolit primer adalah senyawa-senyawa yang terdapat pada semua sel dan memegang peranan sentral dalam metabolisme dan reproduksi sel-sel tersebut. Contoh metabolit primer antara lain asam nukleat, asam amino, dan gula. Polimer adalah senyawa penyusun sel yang terdiri dari senyawa yang memiliki berat molekul yang tinggi, seperti selulosa, lignin, dan protein. Metabolit sekunder adalah senyawa yang secara khusus terdapat pada jenis atau spesies tertentu saja (Hanson, 2011).

Berbeda dengan senyawa metabolit primer yang pada umumnya memberi pengaruh biologi terhadap sel atau organisme tanaman itu sendiri, metabolit sekunder (MS) memberikan pengaruh biologi terhadap sel atau organisme lain. Menurut Wink (2010) metabolit sekunder bukanlah produk buangan yang tak berguna, tetapi perangkat yang penting untuk melawan herbivora dan mikroba. Beberapa metabolit sekunder berfungsi sebagai molekul isyarat untuk menarik arthropoda penyerbuk, hewan penyebar benih, dan sebagai senyawa isyarat dalam hubungan tanaman-tanaman, tanaman-binatang, dan tanaman-mikrobia.

Senyawa metabolit sekunder banyak sekali jumlahnya. Menurut Springob dan Kutchan (2009), ada lebih dari 200000 struktur produk alamiah atau produk metabolit sekunder. Untuk memudahkan, perlu dibuat klasifikasi.

Ada beberapa cara klasifikasi bisa dibuat, seperti berdasarkan sifat struktur, asal-usul biosintesis, atau lainnya. Berdasarkan sifat strukturnya, Hanson (2011 membagi MS ke dalam 6 golongan, yaitu 1) poliketida dan asam lemak, 2) terpenoid dan steroid, 3) fenilpropanoid, 4) alkaloid, 5) asam amino khusus dan peptida, dan 6) karbohidrat khusus.

Berdasarkan asal-usul biosintesisnya, Springob dan Kutchan (2009) membagi MS menjadi empat kelompok, yaitu 1) alkaloid, 2) fenilpropanoid, 3) poliketida, dan 4) terpenoid. Berdasarkan kandungan N, Wink (2010) membagi MS ke dalam dua kelompok besar, yaitu1) MS yang mengandung N dan 2) MS yang tidak mengandung N. Kelompok pertama dibagi lagi menjadi 7 anak kelompok, dan kelompok kedua dibagi lagi menjadi 10 anak kelompok. Pembagian dan jumlah MS dapat dilihat pada Tabel 1.

Table 1. Kelompok metabolit sekunder dan jumlahnya pada tanaman tingkat tinggi

Jenis metabolit sekunder

Jumlaha

Mengandung Nitrogen

Alkaloid

21 000

Asam amino bukan protein

700

Amina

100

Glikosida sianogenik

60

Glucosinolat

100

Alkamida

150

Lektin, peptida, polipeptida

2000

Tanpa Nitrogen

Monoterpen (C10)b

2500

Sesquiterpen C15)b

5000

Diterpen (C20)b

2500

Triterpen, steroid, saponin (C30, C27)b

5000

Tetraterpen (C40)b

500

Flavonoid, tannin

5000

Fenilpropanoid, lignin, coumarin, lignan

2000

Poliacetilen, asam lemak, lilin

1500

Poliketida

750

Karbohidrat, asam organik

200

aPerkiraan jumlah dari struktur yang diketahui.

bTotal jumlah terpenoid melebihi 22000 saat ini.

Sumber: Wink (2010)

Biosintesis Metabolit sekunder

Ada 2 lintasan biosintesis MS. Pertama adalah lintasan metabolisme dasar seperti glikolisis dan siklus Krebs. Kedua adalah lintasan shikimate. Lintasan metabolisme dasar dan shikimate (Wink, 2010) masing-masing dapat dilihat pada Gambar 1 dan Gambar 2.

clip_image004

Gambar 1. Lintasan metabolisme dasar dari sintesis metabolit sekunder (Wink, 2010)

 

clip_image006

Gambar 2. Lintasan shikimate sintesis metabolit sekunder (Wink, 2010)

Poliamina

Poliamina adalah senyawa polikation berberat molekul rendah yang ditemukan dalam semua makhluk hidup (Kaur-Sawhney, 2003; Kusano, 2008), seperti bakteri, jamur, hewan, dan tanaman tingkat tinggi (Baron dan Stasolla (2008). Dilihat dari strukturnya, poliamina termasuk dalam golongan amina. Namun, secara fisiologis, poliamina bisa dimasukkan ke dalam golongan alkaloid (Harbone, 1984; Robert, 2010).

Secara kimiawi, poliamina merupakan senyawa organik yang mempunyai dua atau lebih gugus amino utama –NH2, dapat berupa senyawa sintetik dan juga alami. Senyawa poliamina sintetik termasuk etilen diamine H2N–CH2–CH2–NH2, 1,3-diaminopropane H2N–(CH2)3–NH2, dan hexamethylenediamine H2N–(CH2)6–NH2. Senyawa poliamina alami meliputi putrescine H2N–(CH2)4–NH2, cadaverine H2N–(CH2)5–NH2, spermidine H2N–(CH2)4–NH–(CH2)3–NH2, and spermine H2N–(CH2)3–NH–(CH2)4–NH–(CH2)3–NH2n (Wikipedia, 2012). Struktur molekul poliamina alami dapat dilihat pada Gambar 3.

clip_image008

Gambar 3. Molekul Poliamina (sumber: Oryza, 2012)

Pada sel tumbuhan poliamina terdapat terutama dalam bentuk diamine putrescine (Put), triamine spermidine (Spd), dan tetramine spermine (Spm)( Kaur-Sawhney (2003; Vadim, 2009). Poliamina ini ada dalam bentuk bebas atau sebagai konjugat yang terikat pada asam fenolik dan pada senyawa berberat molekul rendah lain atau pada makromolekul seperti protein dan asam nukleat (Kaur-Sawhney, 2003)

Groppa dan Benavides (2007) menyatakan bahwa Put, SPd, dan Spm merupakan Poliamina utama yang dijumpai pada semua sel makhluk hidup. Senyawa ini merupakan senyawa nitrogen alifatik yang bermuatan positif pada pH fisiologis. Sifatnya ini memungkinkan poliamina berinteraksi dengan makromolekul yang bermuatan negatif, seperti DNA dan RNA, protein dan fosfolipid.

Menurut Kusano (2008) awal penemuan poliamina adalah sekitar tahun 1678 ketika ditemukan kristal tiga sisi pada semen manusia. Karena banyak terdapat dalam sperma, maka senyawa ini dinamai dengan spermine. Spermidine pertama ditemukan pada pankreas. Spermine dan spermidine bertanggung jawab pada bau khas dari semen. Dua senyawa lainnya putrescine dan cadaverine ditemukan pada bakteri dekomposisi.

Biosintesis Poliamina

Pada tanaman, poliamina terdapat dalam sitoplasma, vakuola, mitokondria dan kloroplas. Sintesis poliamina dimulai dari dua molekul prekursor asam amino, yaitu L-arginine dan L-methionine (Kusano, 2008).

Ada dua lintasan alternatif. Lintasan pertama, dimulai dari arginine. Kemudian, diamine putrescine disintesis melalui ornithine oleh arginase dan ornithine dekarboksilase. Putrescine dapat juga disintesis melalui agmatine oleh tiga reaksi berantai yang dikatalisir masing-masing oleh enzim arginine dekarboksilase, agmatine iminohydrolase, dan N-carbamoylputrecine amidohydrolase. Putrescine dikonversi menjadi spermidine oleh aksi spermidine sintase. Lintasa kedua, dimulai dari methionin kemudian diubah menjadi S-adenosylmethionine dua reaksi yang berurutan oleh methionine adenosyltransferase dan S-adenosylmethionine dekarboksilase (Kusano, 2008)

Secara ringkas, poliamina disintesis dari arginine dan ornithine oleh arginine decarboxylase dan orthinine decarboxylase. Senyawa antara agmatine, yang disintesis dari arginine, diubah menjadi Put, yang kemudian ditransformasi menjadi Spd dan Spm . Untuk lebih jelasnya, lintasan biosintesis Poliamina dapat dilihat pada Gambar 4 (Kaur-Sawhney, 2003). Biosisntesis alternative, methionin diubah menjadi S-adenosylmethionine oleh methionine adenosyltransferase dan S-adenosylmethionine dekarboksilase kemudian terbentuk spermidine dan berikutnya spermine (Kusano, 2008). Lintasan biosintesis poliamina dapat dilihat pada Gambar 4.

clip_image010

Gambar 4. Lintasan biosintesis poliamina pada tumbuhan (Kaur-Sawhney, 2003).

Peran dan Kegunaan Poliamina

Dari beberapa macam pendekatan dan bukti yang ada, poliamina terlibat dalam banyak proses di dalam tanaman. Proses tersebut berupa 1) proses fisiologis pertumbuhan dan perkembangan dan 2) proses pertahanan dan kelangsungan hidup.

Pada proses pertumbuhan dan perkembangan, poliamina terlibat dalam beragam proses seperti replikasi DNA, transkripsi gen, pembelahan sel, perkembangan organ, perkembangan dan pemasakan buah, senescence daun (Kaur-Sawhney, 2002; Groppa dan Benavides, 2007; Kusano, 2008; Gilli dan Tusteja , 2010). Baron dan Stasolla (2008) memberikan daftar yang lebih panjang lagi terhadap keterlibatan poliamina dalam proses fisiologis tumbuhan. Proses tersebut meliputi pembelahan sel, embriogenesis, organogenesis, perkembangan bintil akar, perkembangan bunga, buah, dan polen, senescence, perkecambahan benih, sintesis alkaloid tropane, dinamisasi sitoskeletal, respons stres, fotosintesis, dan berinteraksi dengan hormon. Kusano (2008) menambah daftar peran poliamina, termasuk regulasi ekspresi gen, translasi, proliferasi sel, modulasi signaling sel, dan stabilisasi membran. Poliamina juga memodulasi aktivitas unit tertentu dari saluran ion.

Poliamina juga terlibat dalam proses pertahanan dan kelangsungan hidup. Peran poliamina ini terlihat pada tumbuhan yang mengalami cekaman, baik cekaman abiotik maupun cekaman biotik ((Kaur-Sawhney, 2002; Groppa dan Benavides, 2007; Kusano, 2008; Gilli dan Tusteja , 2010). Pada cekaman abiotik, seperti salinitas, kekeringan, suhu ekstrem, hipoksia, dan malnutrisi, tanaman banyak mengakumulasi poliamina. Pada cekaman biotik, seperti serangan hama dan penyakit, tanaman juga meresponsnya dengan meningkatkan konsentrasi poliamina dalam sel pada jaringan yang terserang (Baron dan Stasolla (2008) ); Kusano, 2007).

Dari segi manfaatnya, poliamina dapat digunakan untuk penanda kanker dan penemuan obat anti kanker. Menurut Vadim (2009) poliamina terlibat dalam sejumlah reaksi biokimia dan digunakan sebagai penanda kanker dan analognya digunakan sebagai obat anti kanker.

Dalam dunia farmasi dan kecantikan, poliamina diklaim dapat memberberikan banyak manfaat. Oryza (2011) menyebutkan bahwa poliamina dapat mencegah arteriosceloris, merangsang pertumbuhan rambut dan kuku, merangsang keratinocytes dan keratin serta berperan sebagai anti aging.

Peran Poliamina terhadap Cekaman Abiotik

Palavan-Ünsal (1995) menyatakan bahwa tanaman tingkat tinggi yang terpapar kondisi lingkungan yang suboptimal atau tercekam meresponsnya dengan mengakumulasi Putrescin dalam konsentrasi tinggi. Pengamatan ini awalnya dimulai oleh Richards dan Coleman tahun 1952 pada tanaman barley yang ditanam pada kultur hidroponik yang kekurangan ion K+. Sejak itu, kondisi cekaman lain juga menunjukkan akumulasi putrescin, antara lain kekurangan air, konsentrasi osmotik internal dan eksternal yang tinggi, konsentrasi NH4+ yang tinggi, H+ dan konsentrasi kation monovalen lainnya, larutan ambien, polutan SO2, O3, Pb2+, suhu rendah, dan suhu tinggi.

Groppa dan Benavides (2008) mereview peran poliamina terhadap salinitas, kekeringan dan stres osmotik. Mereka menyatakan bahwa cekaman garam dan kekeringan adalah dua cekaman abiotik utama di bidang pertanian dan rendahnya potensi air merupakan konsekuensi umum dari keduanya. Salinitas merupakan kendala lingkungan yang kompleks yang disebabkan oleh dua hal, yakni 1) komponen osmotik karena penurunan potensi osmotik eksternal dari larutan tanah dan 2) komponen ionik yang terkait dengan akumulasi ion beracun pada konsentrasi tinggi (terutama Na dan Cl). Konsentrasi garam yang tinggi mengganggu integritas membran sel, aktivitas berbagai enzim dan fungsi aparatus fotosintesis.

Tanaman menanggapi perubahan kondisi lingkungan yang kurang menguntungkan ini dengan mengakumulasi senyawa osmolit berberat molekul rendah seperti prolin dan poliamina. Sampai saat ini, masih belum jelas komponen stres garam yang mana yang bertanggung jawab terhadap akumulasi poliamina, apakah komponen osmotik ataupun komponen ionik, meski banyak laporan telah mencoba untuk menjelaskan petunjuk penting ini selama bertahun-tahun. Demikian pula, belum jelas benar poliamina yang mana yang paling berperan pada kondisi stres ? apakah putrescin, spermidin, atau spermin.

Pengukuran kandungan poliamina pada beberapa kultivar padi menunjukkan bahwa kultivar padi yang toleran garam mempertahankan taraf poliamina yang tinggi, yaitu spermidin (Spd) dan spermin (Spm), sedangkan kultivar padi sensitif garam hanya mempertahankan putrescin (Put) yang tinggi. Kultivar toleran garam AU1, Co43, dan CSC1 efektif dalam mempertahankan konsentrasi Spd dan Spm yang tinggi, sedangkan kandungan Putrescin tidak signifikan berubah pada analisis pertumbuhan ketika tanaman terpapar salinitas.

Sensitivitas terhadap garam pada padi dikaitkan dengan tingginya akumulasi putrescin dan rendahnya Spd dan Spm dalam tunas kultivar sensitif garam Co36 CSC2, GR3, IR20, TKM4, dan TKM9 pada kondisi salin. Membran plasma akar kultivar padi toleran garam Nonabokra dan Pokkali kaya akan Spm dan Spd, sedangkan membran plasma akar kultivar sensitif (M-1-48 dan IR8) hanya kaya akan Put.

Kelihatannya Spd dan Spm berperan terhadap komponen osmotik dan responsnya lebih lama sedangkan Put lebih berperan terhadap komponen ionik yang beracun dan responsnya lebih cepat tetapi sementara. Pada penelitian menggunakan NaCl (100 dan 200 mM) dan mannitol (200 dan 400 mM) pada kalus Fraxinus angustifolia, ditemukan bahwa dalam waktu singkat (30 menit) Put dan Spd meningkat sebagai konsekuensi dari perlakuan garam, dan akumulasi yang terus berlanjut dari Spd dan Spm akibat mannitol.

Poliamina kemungkinan besar berperan dalam menambah rigiditas permukaan membran mikrosomal, menstabilkannya terhadap NaCl dan stres osmotik. Lebih lanjut, konsentrasi poliamina yang lebih tinggi yang terikat pada membran mikrosomal kemungkinan dapat mengurangi pengaruh buruk dari NaCl dan kekurangan air.

Dalam kaitannya dengan kekeringan, kelihatannya spermidin lebih berperan, diikuti spermin. Ada penelitian yang melaporkan bahwa Spd merupakan poliamina utama dalam jaringan yang tercekam kekeringan. Penelitian pada akar kecambah chickpea dan kedelai berumur 7 hari yang diperlakukan dengan cekaman kekeringan 0,8 MPa, menunjukkan bahwa total dan individu poliamina lebih tinggi pada chickpea dibanding kedelai. Tanaman chickpea lebih tahan kekeringan dan mengandung lebih banyak Put dan Spd dibanding tanaman kedelai. Kecambah barley yang diperlakukan dengan Spd sebelum periode kekurangan air mampu mengembalikan peningkatan aktivitas enzim katalase dan peroksidase guaiaco, yang mengindikasikan bahwa Spd dapat mempengaruhi aktivitas enzim penangkap H2O2, dan memoderatkan taraf molekul isyarat ini. Tanaman padi merespons kekeringan dengan meningkatkan Put endogen, tetapi tidak cukup tinggi untuk dikonversi menjadi Spd dan Spm. Sebaliknya, tanaman padi transgenik (Datura adc) menghasilkan Put yang lebih tinggi pada cekaman kekeringan sehingga memacu sintesis Spd dan Spm, kemudian melindungi tanaman dari cekaman kekeringan.

Kusano et al. (2008) lebih jauh mengelaborasi peran poliamina terhadap stres abiotik, khususnya kekeringan. Pada tanaman Arabidopsis, mutan acl5/spms, yang tak mampu memproduksi spermin, menunjukkan hipersensitif terhadap stres garam dan kekeringan dibanding tanaman normal. Fenotipe stres sensitif ini dapat pulih dengan penambahan poliamina eksogen, yaitu putrescin untuk sensitif garam dan spermin untuk sensitif kekeringan. Tanaman Arabidopsis mutan acl5/spsm ini juga hipersensitif terhadap KCl dan tanaman ini juga kekurangan Ca2+. Dari fenomena ini, dapat disimpulkan bahwa kekurangan spermin dapat menyebabkan ketidakteraturan keluar-masuknya ion Ca2+, yang mengakibatkan berkurangnya daya adaptasi terhadap tingginya NaCl dan stres kekeringan. Konsisten dengan data yang ada, poliamina, termasuk spermin, juga dilaporkan menghambat pembukaan stomata dan menginduksi penutupannya. Baru-baru ini juga dilaporkan bahwa poliamina mencegah aliran K+.

Gill dan Tuteja (2010) mengelaborasi aplikasi poliamina eksogen terhadap cekaman kekeringan. Banyak bukti mengindikasikan bahwa aplikasi poliamina eksogen dapat menstabilkan membran sel tanaman dan melindunginya dari kerusakan akibat kondisi stres. Poliamina juga diindikasikan ikut berperan dalam menjaga integritas membran. Pemberian Putrescin eksogen terbukti dapat mengurangi kerusakan oksidatif akibat genangan air pada Allium fistulosuma dengan meningkatnya kapasitas antioksidan. Ditemukan juga bahwa aplikasi Put eksogen menyebabkan berkurangnya kandungan senyawa radikal superoksida O2 dan H202, sehingga mengurangi stres oksidatif pada sel tanaman.

Produksi Poliamina

Konsentrasi poliamina dalam sel normal tumbuhan ada pada rentang dari beberapa ratus mikromolar sampai beberapa milimolar. Konsentrasi ini diatur secara ketat, karena pada taraf yang lebih tinggi, poliamina bersifat racun terhadap sel dan bisa menyebabkan kematian sel (Kusano, 2008). Kekecualian ada pada sel kanker. Pada sel kanker, konsentrasi poliamina melebihi konsentrasi pada sel normal (Yatin, 2002). Pengaturan konsentrasi poliamina dalam sel kelihatannya dilakukan tanaman pada beberapa tahapan proses produksi poliamina.

Produksi Poliamina dalam tumbuhan ditentukan oleh empat hal, yaitu sintesis, penyerapan, transpor, dan degradasi (Yatin, 2002;Kusano, 2008). Namun demikian, penyerapan dan transpor poliamina belum dapat dipertimbangkan dalam proses produksi karena kedua proses tersebut belum diketahui secara detail. Kusano (2008) menyatakan bahwa transpor poliamina pada tumbuhan masih dalam bentuk hipotesis. Demikian pula halnya, poliamina degradasi, mekanismenya masih belum cukup jelas. Untuk poliamina penyerapan, Yatim (2002) menyatakan bahwa poliamina penyerapan dan poliamina sintesis dapat saling disubstitusi. Oleh karena itu, untuk saat ini, pertimbangan bagi produksi poliamina hanyalah dari sisi sintesisnya.

Pada tahap sintesis, produksi poliamina kemungkinan dapat dimanipulasi dengan berbagai cara antara lain dengan memanipulasi bahan baku, produk antara, enzim-enzim yang terlibat, dan faktor lingkungan yang mempengaruhi produksi poliamina dalam lintasannya, terutama faktor cekaman biotik dan abiotik. Namun demikian, pemilihan bahan baku dan paparan terhadap cekaman merupakan pendekatan yang lebih praktis.

Beberapa jenis tanaman secara alamiah mengandung banyak poliamina di dalam sel dan jaringannya. Menurut Okamoto (1997) dan Oryza (2011) gandum, kedelai dan turunannya, serta teh mengandung banyak poliamina. Kandungan poliamina pada berbagai jenis bahan pangan yang berasal dari tumbuhan disajikan pada Gambar 5.

Paparan tumbuhan pada berbagai cekaman juga merupakan pilihan yang rasional. Banyak penelitian telah membenarkan bahwa cekaman biotik dan abiotik meningkatkan kandungan poliamina dalam tumbuhan. Bentuk cekaman dapat berupa salinitas, kekeringan, suhu ekstrem, hipoksia, dan malnutrisi, serta serangan hama dan penyakit (Alcazar, 2006; Kusano, 2007). Namun demikian Selmar (2007) mengingatkan bahwa peningkatan kandungan metabolit sekunder, termasuk poliamina lebih bersifat kualitatif daripada kuantitatif. Hal ini dikarenakan umumnya tanaman dalam keadaan tercekam pertumbuhan dan produksi total biomassanya rendah, sehingga secara kuantitatif trade off dengan tingginya kandungan metabolit sekunder.

clip_image012

Gambar 5. Kandungan Poliamina dalam jenis pangan dan minuman (Oryza 2011).

DAFTAR PUSTAKA

Alca´zar, R. F. Marco, J. C. Cuevas, M. Patron, A. Ferrando, P. Carrasco, A. F. Tiburcio, T. Altabella. 2006. Involvement of Polyamines in plant response to abiotic stress. Biotechnol Lett 28:1867–1876.

Baron, K. and C. Stasolla. 2008. The role of Polyamines during in vivo and in vitro Development. In Vitro Cell.Dev.Biol.-Plant (2008) 44:384–395

Gill, S.S. and N. Tuteja. 2010. Polyamines and abiotic stress tolerance in plants. Plant Signaling & Behavior 5:1, 26-33. Landes Bioscience.

Groppa, M. D. and M. P. Benavides. 2008. Polyamines and abiotic stress: recent advances. Amino Acids (2008) 34: 35–45

Hanson, J. R. 2011. Natural Products: The Secondary Metabolites. University of Sussex

Harborne, J. B. 1984. Phytochemical Methods. Chapman and Hill, Hongkong. In Vitro Cell.Dev.Biol.-Plant 44:384–395.

Kaur-Sawhney, R. , A. F. Tiburcio, T. Altabella, and A. W. Galston. 2003. Polyamines in plants: An overview. Journal of Cell and Molecular Biology 2: 1-12. Haliç University, Turkey.

Kusano, T., T. Berberich · C. Tateda · Y. Takahashi. 2008. Polyamines: essential factors for growth and survival. Planta (2008) 228:367–381.

Kusano, T., K. Yamaguchi, T. Berberich, Y. Takahashi. 2007. The Polyamine Spermine Rescues Arabidopsis from Salinity and Drought Stresses. Plant Signaling & Behavior 2:4, 251-252.

Okamoto A., E. Sugi, Y. Koizumi. F. Yanagida, dan S. Udaka. 1997. Polyamine content of ordinary foodstuffs and various fermented foods. Bios ci.Biotech.Biochem.61(9):1582 – 1584. www.jstage.jst.go.jp/article/bbb1992/61/9/61_9_1582/_pdf.

Oryza. 2011. Polyamine: Natural Ingredient for Healthy Hair and Nail Treatment with Anti-ageing. www.oryza.co.jp/html/…/Poliamina_vol.2.pd. Diakses 21 Oktober 2012.

Palavan-Ünsal, N. 1995. Stress and polyamine metabolism. Bulg. J. Plant Physiol., 1995, 21(2-3), 3–14

Roberts, M.F. , D. Strack and M. Wink. 2010. Biosynthesis of alkaloids and betalains. Annual Plant Reviews 40, 20 – 91. Www.Interscience.Wiley.Com

Royal Society of Chemestry.

Selmar, D. 2007. Potential of salt and drought stress to increase pharmaceutical significant secondary compounds in plants. Agriculture and Forestry Research 1/2(58):139-144 2007.

Springob and Kutchan (2009). Introduction to the Different Classes of Natural Products. Eds. A. E. Osbourn • and V. Lanzotti. Plant-derived Natural Products: Synthesis, Function, and Application. Springer.

Wikipedia. 2012. Polyamine. http://en.wikipedia.org/wiki/Poliamina. Diakses 21 Oktober 2012.

Wink, M. 2010. Introduction: Biochemistry, Physiology and Ecological Functions of Secondary Metabolites. Annual Plant Reviews 40, 1–19. Www.Interscience.Wiley.Com

Yatin, M. 2002. Polyamines in living organisms. Journal of Cell and Molecular Biology 1: 57-67. Golden Horn University, Printed in Turkey.

Kajian Pengaruh Salinitas terhadap Pertumbuhan, Kandungan Polifenol, dan Respons Fotosintesis Pada Tanaman Vetiveria zizanioides (L.) Nash

A.V. Mane1, G. D. Saratale2,#, B. A. Karadge3 and J. S. Samant4

1Department of Environmental Sciences, Fergusson College, Pune, India; 2Department of Biotechnology, Fergusson College, Pune, India; 3Department of Botany, Shivaji University,Kolhapur, India; 4Department of Environmental Sciences, Shivaji University, Kolhapur, India;#Department of Biological Environment, College of Agriculture and Life Sciences, Kangwon National University, Chuncheon, Gangwondo, 200-701, South Korea

Emir. J. Food Agric. 2011. 23 (1): 59-70

http://ejfa.info

 

Diterjemah dan Diinterpretasi oleh

Muhammad Hatta

 

 

ABSTRAK

Salinitas adalah salah satu cekaman abiotik utama yang berpengaruh buruk terhadap produktivitas dan kualitas tanaman. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari perubahan karakteristik pertumbuhan, pigmen fotosintesis dan kandungan polifenol Vetiveria zizanioides (L.) di bawah pengaruh salinitas natrium klorida. Hasil penelitian menunjukkan bahwa panjang tunas Vetiveria zizanioides mengalami peningkatan sebesar 18,6% pada konsentrasi NaCl 200 mM, sedangkan peningkatan panjang akar sekitar 24,8% diamati pada 50 mM NaCl. Rasio tunas/akar berkurang menjadi 10,0% pada konsentrasi 50 mM, sedangkan pada salinitas NaCl 300 mM meningkat sebesar 39,09%. Selain itu, luas daun rata-rata juga meningkat pada kondisi salin. Peningkatan pigmen fotosintetik pada kadar garam yang rendah menunjukkan adanya mekanisme penyesuaian osmotik yang dikembangkan oleh spesies rumput ini untuk menghadapi stres garam. Namun, berat kering dan berat segar biomassa tanaman kurang efektif di bawah stres salinitas. Meningkatnya kandungan polifenol pada salinitas tinggi mungkin disebabkan oleh akumulasi metabolit sekunder. Ada peningkatan konduktivitas listrik dan total padatan terlarut tanah pada salinitas tinggi. Adanya peningkatan peubah pertumbuhan dan fotosintesis yang diamati khususnya pada konsentrasi NaCl 100 mM menunjukkan bahwa rumput ini toleran dan kami menyimpulkan bahwa V. zizanioides dapat ditanam pada daerah bergaram dengan konsentrasi hingga 200 mM.

Kata kunci: Vetiveria zizanioides, pigmen fotosintesis, polifenol, salinitas, karakteristik pertumbuhan, konduktivitas listrik

PENGANTAR

Tanah adalah sumber daya yang berharga terutama di bidang pertanian dan kehutanan, karena tanah diperlukan untuk menghasilkan tanaman, sayuran, buah-buahan, kayu, dan kegitan ekonomi penting lainnya (NEP, 2006). Untuk kesejahteraan generasi mendatang, pengelolaan sumber daya tanah yang berkelanjutan menjadi isu utama di seluruh dunia (Munns, 2002). Sudah diakui bersama bahwa cekaman abiotik termasuk angin kencang, suhu ekstrim, salinitas, kekeringan, banjir dan bencana alam lainnya, seperti tornado dan kebakaran memiliki dampak negatif terhadap organisme yang hidup di suatu lingkungan spesifik dan merupakan faktor yang paling menghambat terhadap pertumbuhan dan produktivitas tanaman di seluruh dunia (Mane et al., 2010). Diantara faktor cekaman abiotik di atas, salinitas merupakan salah satu cekaman abiotik utama yang berpengaruh buruk terhadap produktivitas dan kualitas tanaman dengan peningkatan dampak pada aspek sosial ekonomi dan kesehatan, terutama pada masyarakat petani. Salinitas adalah istilah umum yang digunakan untuk menggambarkan adanya peningkatan kadar garam seperti natrium klorida, magnesium dan sulfat kalsium, dan bikarbonat dalam tanah dan air (Ouda, 2008).

Survei literatur menunjukkan bahwa luasnya daerah yang terkena garam diperkirakan mendekati satu miliar hektar, yakni sekitar 6% dari luas permukaan bumi (FAO, 1997). Di samping itu, sekitar 77 juta hektar lahan telah tersalinasi oleh kegiatan manusia seperti, irigasi tanpa sistem drainase yang tepat, industri limbah, penggunaan pupuk berlebihan, penghilangan tanaman penutup tanah, banjir air asin, permukaan air tanah yang tinggi, dan penggunaan air tanah berkualitas rendah (Parida dan Das, 2005). Lebih lanjut, Oldeman et al. (1991) memperkirakan bahwa 76 juta hektar lahan menjadi salin, dengan 58% terkonsentrasi di daerah beririgasi. Evaluasi terbaru yang dibuat oleh lembaga ini mengungkapkan bahwa hampir 6.730.000 hektar wilayah di India terpengaruh garam (CSSRI, 2009). Ketika salinisasi tanah dinilai dari segi ekonomi, maka alasan untuk khawatir tentang hal itu menjadi lebih jelas. Misalnya, kerusakan ekonomi yang disebabkan oleh salinisasi sekunder diperkirakan mencapai US $ 750 juta per tahun pada bantaran sungai Colorado di Amerika Serikat, sedangkan di timur laut benua Asia, kerugian ditaksir sekitar US $ 300 juta per tahun dan US $ 208 juta per tahun di lembah Murry-Darling di Australia (Ghassemi et al., 1995).

Secara fisiologis dan genetik, toleransi garam adalah sesuatu yang kompleks di antara varietas tanaman dengan berbagai kemampuan adaptasi tanaman halofit dan tanaman yang kurang toleran (Bunga, 2004). Analisis pertumbuhan merupakan elemen mendasar untuk mempelajari respons tanaman terhadap cekaman lingkungan. Selain itu, fotosintesis merupakan salah satu lintasan biokimia yang paling penting, dimana tanaman mempersiapkan sendiri bahan makanannya dan bertumbuh (Kojo, 2004) sedangkan, konsentrasi polifenol dapat dijadikan sebagai indikator kondisi cekaman (Kate, 2008). Pada konsentrasi natrium klorida yang tinggi, dilaporkan terjadi penurunan pertumbuhan genus Populus L. (Sixto et al., 2005). Selain itu, klorofil dan kandungan karotenoid merupakan indikator penting dari tanaman yang sehat dan pernah dilaporkan adanya peningkatan kandungan klorofil pada lingkunan salin, tergantung pada kadar garam (Mane et al., 2010). Beberapa peneliti melaporkan bahwa ada peningkatan kandungan polifenol pada tingkat salinitas yang tinggi, yang menunjukkan bahwa induksi metabolisme sekunder adalah salah satu mekanisme pertahanan yang digunakan oleh tanaman untuk menghadapi lingkungan salin (Kate, 2008).

Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari perubahan karakteristik pertumbuhan, pigmen fotosintesis, dan polifenol Vetiveria zizanioides di bawah pengaruh salinitas natrium klorida. Penelitian ini akan berguna untuk pengembangan spesies toleran garam untuk tujuan fitoremediasi.

BAHAN DAN METODE

Bahan yang digunakan

Bibit Vetiveria zizanioides (L.) Nash diperoleh dari kebun bibit pemerintah, Kolhapur, India (Gambar 1). Bibit dipotong secara seragam dengan panjang minimum (kira-kira 4 cm) yang diperlukan untuk pertumbuhannya dan kemudian dipindahtanamkan ke dalam pot tanah (tinggi 30 cm dengan dasarnya menyempit). Pot tanah digunakan pada penelitian ini dengan tujuan untuk melihat dampak dosis salinitas yang akurat yang diberikan pada medium perakaran. Untuk bertumbuh dan berkembang pada kondisi normal, maka diberikan penyiraman secara teratur. Setelah empat minggu, kemudian dipelajari pertumbuhan dalam keadaan tercekam. Tanaman diperlakukan dengan konsentrasi garam natrium klorida yang meningkat, yaitu konsentrasi 25, 50, 100, 200, dan 300 mM. Setiap selang satu hari, tanaman disiram dengan volume ganda untuk mempertahankan konsentrasi garam yang seragam dalam pot dan untuk mengatasi kehilangan air akibat evapotranspirasi dari permukaan tanah dan transpirasi dari permukaan tanaman. Bahan kimia yang digunakan memiliki kemurnian yang tertinggi yang tersedia dan lulus standar analitis.

clip_image004

Gambar 1. Foto Vetiveria zizanioides (L.) Nash dengan sistem akar yang kompleks yang memegang tanah yang terkontaminasi.

Kajian karakter pertumbuhan

Sepuluh tanaman V. zizanioides dari setiap pot perlakuan dengan hati-hati dibongkar akarnya dan dicuci bersih dengan air untuk menghilangkan kotoran tanah dan partikel debu dari permukaan bagian tanaman dan diresapkan pada permukaan yang kering. Tanaman diamati panjang akar, panjang tunas, rasio tunas:akar, tinggi tanaman dan luas daun. Untuk peubah produksi biomassa, berat basah dan berat kering, dan kandungan air diukur dari sepuluh daun random sampel.

Estimasi pigmen fotosintesis

Kandungan klorofil

Klorofil daun dewasa diestimasi dengan metode Armon (1990) dengan sedikit modifikasi. Bahan tanaman segar (1g) digerus dalam morter pada suhu 2⁰C dalam kondisi gelap dan ekstraksi dilakukan dengan aceton 90%, dengan penambahan sedikit magnesium karbonat, untuk melindungi dan menstabilkan klorofil. Ekstrak ini disaring dengan kertas saring Whatman No.1 dengan pengisapan menggunakan corong Buchner. Sisanya dibilas bersih 2-3 kali dengan aceton 90%, kumpulkan semua bilasan pada filtrat yang sama dan volume akhir dari filtrat dibuat sampai 100 ml dengan aceton 90%. Serapan klorofil a dan b diukur dengan menggunakan spektofotometer UV-Visible sinar ganda (Elico Sl-159, India), pada 663 dan 645 nm dengan menggunakan aceton 90% sebagai blank. Formula berikut digunakan untuk menentukan kandungan klorofil.

Klorofil a = X = 12.7 x A663 – 2.69 x A645

Klorofil b = Y = 22.9 x A645 – 4.68 x A663

Total klorofil (a + b) = Z = 8.02xA663+ 20.20 x A645

Klorofil (a)(b)(total) (mg/daun segar) = clip_image006

Kandungan karotenoid

Kandungan karotenoid daun ditentukan dari ekstrak yang sama dengan yang digunakan untuk estimasi klorofil, dengan mengukur serapan pada 480 nm dengan menggunakan spektrofotometer sinar ganda UV-VIS dengan meletakkan aceton 90% sebagai control. Kandungan karotenoid dihitung dengan formula berikut (Kirk and Allen, 1965).

Karotenoid = clip_image008

Kandungan polipenol

Kandungan polipenol daun diestimasi berdasarkan metode dari Folin dan Denis (1915). Dua ml ekstraks aceton yang digunakan pada pengukuran klorofil dicampur dengan 10 ml natrium karbonat 20% dan jadikan volumenya 35 ml dengan air distilasi dan tambahkan 2 ml reagen Folin-Denis, aduk rata dan akhirnya jadikan volume 50 ml dengan air distilasi. Larutan asam tannat standar (0,1 mg.ml-1) digunakan untuk persiapan kurva polipenol standar dengan mengukur serapan pada 660 nm dengan menggunakan spektrofotometer UV-Visible sinar ganda.

Daya hantar listrik dan total padatan terlarut

Daya hantar listrik (EC) dan total padatan terlarut (TDS) dari tanah ayak yang diperlakukan ditentukan setelah selesainya percobaan (setelah minggu ke 10) dengan mempersiapkan suspensi tanah dalam air 1:10. Suspensi ini dikocok kuat, biarkan selama 12 jam dan kemudian disaring dengan kertas saring Whatman No.1 untuk analisis. Kedua peubah ditentukan dengan menggunakan Elico EC-TDS meter (CM 183, Make-India) di mana elektrodanya direndam langsung dalam larutan cawan untuk bacaan hasil langsung pada skala digital.

Analisis statistik

Data dianalisis dengan analisis varians satu faktor (ANOVA) dengan uji perbandingan berganda Tukey-Kramer.

HASIL DAN PEMBAHASAN

Pengaruh salinitas terhadap panjang tunas V.zizanioides

Pada salinitas yang lebih tinggi, panjang tunas yang rendah dengan kandungan air yang rendah telah dilaporkan (Parvaiz and Riffat, 2005). Khosravinejad et al. (2009) juga menemukan penurunan yang nyata pada pemanjanagan tunas pada genotype barley dengan meningkatnya perlakuan NaCl. Pada penelitian ini, panjang tunas V.zizanioides hanya distimulasi oleh taraf salinitas yang lebih rendah. Panjang tunas V.zizanioides meningkat 18,60% pada konsentrasi 200 mM NaCl (Tabel 1.) Akan tetapi, panjang tunas dihambat oleh konsentrasi NaCl yang lebih tinggi (300 mM) pada media perakaran. Ini menunjukkan bahwa spesies rumput-rumputan toleran pada 200 mM NaCl bila dilihat dari pertumbuhan tanaman.

Pengaruh salinitas terhadap panjang akar V.zizanioides

Meningkatnya panjang akar dengan meningkatnya kadar garam telah diketahui pada Triticum aestivum (Maghsoudi dan Maghsoudi, 2008). Pengaruh salinitas NaCl terhadap panjang akar biasanya lebih besar daripada pengaruh salinitas terhadap tunas pada tingkat salinitas yang lebih rendah (Pessarakli et al., 2004). Pada penelitian ini, akar V. zizanioides lebih panjang pada konsentrasi NaCl 50 mM dengan kenaikan sebesar 24,81% (Tabel 1), tetapi pada konsentrasi tertinggi (300 mM), panjang akar berkurang tajam sebesar 31,77% dibandingkan dengan tanaman kontrol. Dari penelitian ini, jelas bahwa pertumbuhan akar spesies rumput yang diuji lebih sensitif dan sangat dipengaruhi oleh tingkat salinitas yang tinggi. Hal ini mungkin karena sifat NaCl yang beracun pada konsentrasi yang tinggi. Rasio tunas/akar pada spesies yang dicobakan menurun menjadi 10,04% pada konsentrasi NaCl 50 mM tetapi kemudian meningkat dengan meningkatkannya dosis salinitas (Tabel 1). Rasio tunas/akar meningkat tajam disebabkan oleh salinitas NaCl, terutama tingkat salinitas yang tinggi. Ini mungkin disebabkan lebih banyaknya alokasi asimilat dari akar ke tunas.

Pengaruh salinitas terhadap tinggi tanaman V. zizanioides

Hambatan pertumbuhan tanaman merupakan salah satu indeks pertanian yang paling penting dari toleransi cekaman garam (Parida dan Das, 2005). Pengaruh langsung dari penambahan garam ke media akar adalah menurunnya potensial air eksternal dan penurunan serapan air (Munns, 2002). V. Zizanioides menunjukkan peningkatanan tinggi tanaman tertinggi sebesar 17,98% pada konsentrasi NaCl 50 mM, namun ada kecenderungan penurunan tinggi tanaman pada konsentrasi NaCl yang lebih tinggi dan perlakuan NaCl yang lebih lama.

clip_image010

Akumulasi ion beracun, Na+ dan Cl-, dalam tanaman sering disebut sebagai penyebab utama penghambat pertumbuhan yang disebabkan oleh salinitas (Marosz dan Nowak, 2008). Jaleel et al. (2008) menemukan bahwa pada cekaman 100 mM NaCl, tinggi tanaman Catharanthus roseus mengalami penurunan sebesar 7% dan 34% pada salinitas rendah dan tinggi dibandingkan dengan kontrol. Pertumbuhan tanaman terjadi terutama karena ekspansi ruang yang dimediasi oleh peningkatan volume vakuola dan penyekatan ion Na+ dan Cl- yang memfasilitasi penyesuaian osmotik yang penting terhadap perkembangan sel (Shuji et al., 2002). Dari hasil penelitian ini, jelaslah bahwa tinggi rumput dipengaruhi secara terbalik oleh tingkat salinitas yang tinggi yang kemungkinan disebabkan oleh rendahnya ketersediaan air dan toksisitas natrium klorida (Gambar 3).

Pengaruh salinitas terhadap luas daun Vetiveria zizanioides

Ketika salinitas diaplikasikan pada media perakaran, pemanjangan daun seketika terhenti pada jagung (Munns et al., 2000), tomat (Tantawy et al., 2009) and jowar (Stuart et al., 2000). Pada penelitian ini, rata-rata luas daun meningkat pada kondisi salin. Persentase maksimum peningkatannya tercatat 18,60% (200 mM) pada V. zizanioides (Tabel 1), sementara pada 300mM NaCl, tercatat berkurang sebesar 5,95% dibanding kontrol. Pada kondisi yang hampir sama, Gilbert et al. (1998) menemukan penurunan sekitar 50% ukuran setiap daun Coleus blumei Benth, tetapi itu tetap sedikit lebih tinggi dibanding dengan daun yang tercekam berat. Hal ini diduga bahwa produksi spesies oksigen reaktif (ROS) pada kondisi cekaman air pada apoplas daun merupakan alasan terhadap peningkatan luas daun pada rumput yang tercekam salinitas. Pengaruh negatif dari salinitas pada tanaman dapat memprovokasi potensial osmotik, sehingga sel akar tidak mendapat air yang diperlukan dari media yang berakibat terjadinya hambatan terhadap penyerapan beberapa hara mineral yang menyebabkan perkembangan tanaman yang buruk.

clip_image012

Gambar 2. Pengaruh salinitas NaCl terhadap pertumbuhan Vetiveria zizanioides

Pengaruh salinitas terhadap biomassa berat basah Vetiveria zizanioides

Beberapa peneliti menemukan rendahnya berat berangkasan basah daun tanamn yang tumbuh pada kondisi salin (Parvaiz and Riffat, 2005). Sebaliknya, Ceyhan and Ali (2002) menemukan meningkatnya berat berangkasan basah tanaman sawi pada kondisi salin yang lebih tinggi. Hampir sama dengan berat kering, berat basah tanaman tidak begitu sensitif terhadap cekaman salinitas. Peningkatan berat basah tanaman pada taraf salinitas yang lebih rendah, seperti pada 25 sampai 100 mM mungkin karena peningkatan kandungan airnya (Tabel 1). Walaupun Vetiveria menunjukkan peningkatan pada berat basahnya hingga konsentrasi 200 mM NaCl dibanding control, namun, kondisinya terbalik pada konsentrasi yang lebih tinggi, 300 mM dan ada penurunan dibanding dengan kontrol sebesar 12,44% (Tabel 1). Ada laporan yang menyatakan bahwa terjadi penurunan berat basah tanaman tomat dan dua varietas gandum, yaitu Afzal and EMB82-12 dengan peningkatan taraf salinitas (Tantawy et al., 2009). Penurunan berat basah daun rumput mungkin disebabkan oleh cekaman kandungan air tanah yang terjadi pada kondisi salin dan penghambatan pertumbuhan oleh cekaman salinitas selama tahap perkembangan awal (Khosravinejad et al., 2009).

Berat Kering

Serupa dengan penurunan pada berat berangkasan basah daun, konsentrasi NaCl yang tinggi juga menyebabkan penurunan berat berangkasan kering daun (Parvaiz dan Riffat, 2005). Berat berangkasan kering Halosarcia pergranulata tertinggi dijumpai pada tanaman yang tumbuh pada 10 sampai 300 mol m-3 NaCl tetapi menurun ketika tanaman diberikan konsentrasi NaCl 400 mol m-3 atau lebih tinggi (Digby dan Timotius, 1999). Berbeda dengan hal itu, Ceyhan dan Ali (2002) melaporkan adanya peningkatan berat kering tanaman selada pada kondisi salin. Cicek dan Cakirlar (2002) juga menemukan penurunan berat kering total pada tanaman jagung berumur 30 hari pada lingkungan salin. Hal ini membuktikan bahwa berat kering tanaman tidak sensitif pada cekaman salinitas. Pada penelitian ini, berat kering V. zizanioides meningkat sebesar 33,60% pada konsentrasi 100 mM NaCl. Vetiveria menunjukkan peningkatan berat kering yang terus berlanjut sampai pada konsentrasi NaCl 200 mM dibanding kontrol, namun dipengaruhi secara terbalik pada konsentrasi yang lebih tinggi, 300 mM (Tabel 1). Hasil tersebut di atas menunjukkan bahwa berat kering daun tanaman meningkat akibat perlakuan salinitas dengan penurunan yang tegas hanya pada konsentrasi NaCl 300 mM. Stimulasi seperti itu dalam produksi bahan kering pada perlakuan salinitas mungkin disebabkan oleh akumulasi ion anorganik dan senyawa organik bagi adaptasi osmotik, sementara penurunan berat kering daun tanaman pada tingkat salinitas tertinggi mungkin disebabkan oleh terhambatnya hidrolisis makanan cadangan dan translokasinya ke bagian titik tumbuh.

Pengaruh salinitas terhadap kadar air V. zizanioides

Tanaman telah mengevolusi mekanisme penyesuaian osmotik, yang mempertahankan penyerapan air dan turgor dalam kondisi cekaman osmotik dan mensintesis senyawa organik yang kompatibel seperti prolin, betaine, poliol, dan gula (Chinnusamy et al., 2005). Meningkatnya kadar air pada lingkungan salin menunjukkan kadar air yang lebih tinggi per unit luas daun, yang dapat mengencerkan garam terakumulasi dalam larutan sel (Marosz dan Nowak, 2008). Hal ini sangat jelas dari persentase kadar air daun yang meningkat karena salinitas NaCl, tetapi ada penurunan drastis dari kandungan air daun pada tingkat konsentrasi NaCl 300 mM. Kadar air daun V. zizanioides meningkat maksimal sebesar 21,33% pada 100 mM NaCl (Tabel 1). Demikian pula Rodriguez et al, 1997 mengamati penurunan cepat dari potensial air daun, konduktansi stomata, dan kandungan air relatif daun pada tanaman tomat. Pada penelitian ini, penurunan kadar air daun rumput pada tingkat cekaman salinitas yang tinggi mungkin disebabkan oleh stres osmotik yang diinduksi oleh NaCl yang tidak dapat dinetralisir oleh tanaman di bawah stres berat, sementara peningkatan pada konsentrasi rendah mungkin karena daya adaptasi tanaman terhadap penyesuaian osmotik yang mempertahankan penyerapan air dan turgor melalui akumulasi senyawa organik.

Pengaruh salinitas terhadap kinerja fotosintesis V. zizanioides

Kandungan Klorofil

Kandungan klorofil dalam tanaman secara langsung berkorelasi dengan kesehatan tanaman (Zhang et al., 2005). Resistensi sistem fotosintesis terhadap salinitas terkait dengan kapasitas tanaman secara efektif menyekap ion-ion dalam sitoplasma, vakuola dan kloroplas (Croser et al., 2001). Rendahnya kandungan klorofil pada kondisi stres merupakan fenomena biasa dan dilaporkan dalam banyak penelitian. Ini mungkin disebabkan oleh kerusakan membran (Djanaguiraman et al., 2006). Hasil penelitian kami menunjukkan bahwa kandungan klorofil Vetiveria tidak banyak terpengaruh oleh salinitas sampai pada konsentrasi NaCl 100 mM, tetapi penurunan kandungan klorofil teramati pada konsentrasi NaCl yang melampaui 100 mM. Konsekuensinya, rasio klorofil a : klorifil b meningkat jauh dalam daun Vetiveria zizanioides yang tumbuh pada konsentrrasi Na Cl sampai dengan 100 mM (Tabel 2). Dengan demikian, kiranya cukup jelas bahwa konsentrasi garam tinggi (300 mM) memiliki pengaruh negatif terhadap rasio klorofil a : klorifil b, pada spesies rumput (Tabel 2). Selanjutnya, juga dapat dilihat bahwa kandungan klorofil a dan klorofil b memiliki kecenderungan yang sama, meningkat atau menurun. Namun demikian, kelihatannya klorofil a lebih sensitif terhadap salinitas dibanding klorofil b.

Penurunan kandungan klorofil ditambah dengan peningkatan konsentrasi garam telah dilaporkan pada Picea mariana, Picea glauca dan Pinus banksiana (Croser et al., 2001). Pada penelitia ini, jelaslah bahwa kandungan klorofil total dalam daun Vetiveria zizanioides lebih tinggi pada salinitas yang lebih rendah. Peningkatan kandungan klorofil yang demikian mungkin disebabkan oleh mekanisme penyesuaian osmotik yang dikembangkan oleh tanaman, sementara penurunan kandungan klorofil pada konsentrasi yang lebih tinggi (300 mM) mungkin terkait dengan gangguan pada fungsi seluler dan kerusakan rantai transpor elektron fotosintesis karena akumulasi ion. Penurunan drastis rasio klorofil a : klorifil b pada konsentrasi salinitas yang lebih tinggi menunjukkan bahwa klorofil a bisa jadi digantikan oleh klorofil b.

clip_image014

Kandungan karotenoid

Dalam proses fotosintesis, karotenoid melindungi kloroplas dari kerusakan foto-oksidatif. Selain itu, karotenoid juga bertindak sebagai pigmen pemanen cahaya untuk menyerap energi cahaya di kisaran 400-500 nm (biru), yang tidak dapat diserap oleh klorofil dan melewatkan energi eksitasi kepada molekul klorofil (Kojo, 2004). Karotenoid juga merupakan salah satu antioksidan nonenzimatik bersama dengan vitamin C, vitamin E, dan asam lipoat dan memainkan peran penting dalam perlindungan terhadap stres oksidatif (Parida dan Das, 2005). Pada penelitan ini, peningkatan maksimum kandungan karotenoid diamati sebesar 23.09% (pada 50 mM NaCl), sementara penurunan drastis sebesar 83.69% (pada 300 mM NaCl) dibanding kontrol dalam daun Vetiveria zizanioides (Tabel 3). Penurunan kandungan karotenoid karena stres salinitas telah diamati pada Brassica juncea, murbei, dan Aegiceros corniculatum (Parida dan Das, 2005). Dari hasil penelitian ini, penurunan kandungan karotenoid dalam daun Vetiveria menunjukkan bahwa konsentrasi garam yang tinggi bertindak sebagai penghambat dan tidak mampu mencegah kloroplas dari kerusakan foto-oksidatif. Sebaliknya pada konsentrasi yang lebih rendah, karotenoid melaksanakan peran pelindungan bagi kloroplas dan bertindak sebagai pigmen.

Pengaruh cekaman salinitas terhadap kandungan polifenol

Perhatian pada pengaruh salinitas terhadap metabolisme polifenol pada tumbuhan sangat sedikit diberikan. Pada penelitian ini, kandungan polifenol daun Vetiveria zizanioides menurun pada tingkat salinitas yang lebih rendah, yaitu 25 dan 50 mM tetapi kemudian ada kenaikan kandungan polifenol (Tabel 3). Peningkatan maksimum kandungan polifenol daun Vetiveria diamati sebesar 37.58% (300 mM) (Tabel 3). Demikian pula, Parida dan Das (2005) mengamati terjadinya akumulasi polifenol pada Bruguiera parviflora dengan peningkatan tingkat salinitas. Menurut mereka, akumulasi polifenol memainkan peran kunci pada tumbuhan terhadap stres. Peningkatan yang besar dari kandungan polifenol daun di bawah kondisi salinitas NaCl telah diamati pada Brassica campastris (Singh dan Kumari, 2006). Peningkatan kandungan polifenol pada kadar salinitas yang tinggi menginduksi akumulasi metabolit sekunder pada spesies yang dicobakan agar dapat mentolerir tingkat stres salinitas yang lebih tinggi dan kondisi yang merugikan.

clip_image016

Konduktivitas listrik (EC)

Konduktivitas adalah ekspresi numerik dari kemampuan air untuk membawa arus listrik yang bervariasi, tergantung pada jumlah dan jenis ion dalam larutan. Pengaruh salinitas NaCl terhadap EC tanah ditentukan dan digambarkan pada Gambar 2. Jelaslah bahwa EC tanah pot meningkat dengan semakin tingginya tingkat NaCl. EC tanah meningkat maksimal sebesar 508,42% pada tanah pot Vetiveria zizanioides pada konsentrasi NaCl 300 mM. Berbagai tingkat EC pada tanah pot mungkin disebabkan oleh kapasitas pengikatan akar tanaman yang berbeda dan persaingan akar untuk mendapatkan nutrisi dari tanah. Kenaikan serupa dalam konduktivitas listrik dari tanah media perakaran karena penambahan NaCl telah dilaporkan sebelumnya (Gokhale et al., 2008).

clip_image018

Gambar 3. Pengaruh natrium klorida terhadap konduktivitas listrik dan total padatan terlarut.

Total Padatan Terlarut (TPT)

Total padatan terlarut secara sederhana adalah jumlah konsentrasi kation dan anion yang dinyatakan dalam mg L-1. Pengaruh salinitas NaCl terhadap TPT tanah diteliti dan diilustrasikan pada Gambar 3. Jelas terlihat bahwa TPT dalam tanah meningkat dengan semakin tingginya tingkat NaCl. TPT meningkat secara maksimal sebesar 982,71% pada Vetiveria zizanioides pada konsentrasi NaCl 300 mM yang ditambahkan ke dalam pot tanah. Pengamatan serupa ditemukan oleh Gokhale et al. (2008) pada tanah media tumbuh akibat penambahan NaCl eksternal. Berbagai tingkat TPT dalam media disebabkan oleh penambahan NaCl eksternal dan interaksinya dengan akar dan ion organik-anoganik telah terjadi dalam tanah asal.

Kesimpulan

Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa panjang tunas dan akar Vetiveria zizanioides dirangsang oleh konsentrasi salinitas yang lebih rendah, sebaliknya dihambat oleh konsentrasi salinitas yang lebih tinggi. Menurunnya berat berangkasan basah daun Vetiveria mungkin disebabkan oleh stres kadar air yang terjadi pada kondisi salin, sementara stimulasi produksi bahan kering karena akumulasi ion anorganik dan senyawa organik terlarut. Penurunan drastis rasio klorofil a : b pada tingkat salinitas yang lebih tinggi menunjukkan klorofil a mungkin digantikan oleh klorofil b. Penurunan kandungan karotenoid dalam daun Vetiveria menunjukkan bahwa konsentrasi garam yang tinggi merupakan penghambat dan tidak dapat mencegah kloroplas dari kerusakan fotooksidatif. Akan tetapi, meningkatnya kadar polifenol pada konsentrasi salinitas yang tinggi menunjukkan bahwa terjadi akumulasi metabolit sekunder untuk meningkatkan toleransi terhadap stress garam yang tinggi. Hasil ini juga mengindikasikan bahwa Vetiveria zizanioides memperlihatkan toleransi salinitas yang lebih baik bila dilihat dari pertumbuhan tanaman yang linier. Spesies ini dapat digunakan untuk reklamasi daerah yang terkontaminasi oleh salinitas tinggi melalui cara fitoremediasi, akan tetapi penelitian lebih lanjut diperlukan untuk mempelajari mekanisme toleransi garam pada tanaman rumput tertentu.

Ucapan Terima Kasih

Penulis berterima kasih kepada Dr. P.D. Raut, Kepala, Departemen Ilmu Lingkungan, Universitas Shivaji, Kolhapur, India atas penyediaan fasilitas yang diperlukan. Penulis juga ingin berterima kasih atas bantuan dan dukungan dari Dr. R.G. Pardeshi, Kepala, Sekolah Tinggi Fergusson, Pune. Penulis mengucapkan terima kasih kepada Dr. A.N. Sadale dan Dr. P.A. Banne atas sarannya yang berharga untuk studi ini.

DAFTAR PUSTAKA

Arnon, D. I. 1949. Copper enzyme in isolated chloroplasts: polyphenol oxidase in Beta vulgaris. Plant Physiol. 24:1-15.

Ceyhan, T. and I. Ali. 2002. Changes induced by salinity, demarcating specific ion ratio (Na/Cl) and osmolality in ion and proline accumulation, nitrate reductase activity and growth performance of lettuce. J. Plant Nutr. 25:27-41.

Chinnusamy, V., J. Andre, and J. K. Zhu. 2005. Understanding and improving salt tolerance in plants. Crop Sci. 45:437-448.

Cicek, N. and H. Cakirlar. 2002. The effect of salinity on some physiological parameters in two maize cultivar. Bulg. J. Plant Physiol. 28:66-74.

Croser, C., S. Renault, J. Franklin, and J. Zwiazek. 2001. The effect of salinity on the emergence and seedling growth of Picea mariana, Picea glauca and Pinus banksiana. Env. Pollution. 115:9-16.

CSSRI. 2009. Central Soil Salinity Research Institute, India. http://www.cssri.org/

Djanaguiraman, M., J. A. Sheeba, A. K. Shanker, D. Durgadevi and U. Bangarusamy. 2006. Rice can acclimate to lethal level of salinity by pre-treatment with sub lethal level of salinity through osmotic adjustment. Plant Soil. 284:363-373.

Digby, C. S. and D. C Timothy. 1999. Salt tolerance in the halophyte Halosarcia pergranulata subsp. pergranulata, Ann.Bot. 83:207-213.

FAO. 1997. <http://www.fao.org/ag/agl/agll/spush/table3.htm&gt;.

Flowers, T. J. 2004. Salt tolerance is complex genetically and physiologically. J. Exp. Bot. 55:307-319.

Folin, O. and W. Denis. 1915. A calorimetric estimation of phenols and phenol derivatives in urine. J. Biol. Chem. 22:305-308.

Ghassemi, F., A. J. Jakeman, and H. A. Nix. 1995. Salinisation of land and water resources: human causes, extent, management and case studies. Australian National University, Canberra, Australia and CAB International, Wallingford, Oxon, UK.

Gilbert, G. A., M. V. Gadush, C. Wilson, and M. A. Madore. 1998. Amino acid accumulation in sink and source tissues of Coleus bumei benth. during salinity stress. J. Exp. Bot. 49:107-114.

Jaleel, C. A., S. Beemarao, S. Ramalingam, and P. Rajaram. 2008. Soil salinity alters growth, chlorophyll content and secondary metabolite accumulation in Catharanthus roseus, Turk. J. Biol. 32:79-83.

Kate, V. V. 2008. Physiological and biochemical studies in some medicinal plants: Tribulus terrestris L. and Pedalium murex L. Ph. D. Thesis submitted to Shivaji University, Kolhapur, Maharashtra, India.

Khosravinejad, F., R. Heydari, and T. Faboodnia. 2009. Effect of salinity on organic solutes contents in barley. Pak. J. Biol. Sci. 12:158-162.

Kirk, J. O. T. and R. L. Allen. 1965. Dependence of salinity stress on the activity of glutamine synthatase and glutamate dehydrogenase in triticale seedlings. Polish J. Env. Studies. 14:523-530.

Kojo, S. 2004. Vitamin C: Basic metabolism and its function as an index of oxidative stress. Curr. Med. Chem. 11:1041-1064.

Mane, A. V., B. A. Karadge and J. S. Samant, 2010. Salinity induced changes in photosynthetic pigments and polyphenols of Cymbopogon nardus (L.) Rendle. J. Chem. Pharm. Res. 2:338-347.

Marosz, A. and J. S. Nowak. 2008. Effect of salinity stress on growth and macroelements uptake of four tree species. Dendrobiol. 59:23-29.

Maghsoudi, A. M. and K. Maghsoudi. 2008. Salt stress effects on respiration and growth of germinated seeds of different wheat (Triticum aestivum L.) Cultivars. World J. Agri. Sci. 4:351-358.

Munns, R. 2002. Comparative physiology of salt and water stress. Plant Cell Environ. 25:239-250

Munns, R., J.Guo, J. B. Passioura, and G. R. Cramer. 2000. Leaf water status controls day-time but not daily rates of leaf expansion in salt-stressed barley. Aust. J. Plant. Physiol. 27:949-957. NEP. 2006. National Environmental Policy of India by Ministry of Environment and Forest.

Oldeman, L. R., E. V. W. P. Van and J. H. M. Pulles. 1991. The extent of human induced soil degradation. In: L. R. Oldeman, R. T. A. Hakkeling and W. G. Sombroek. (Eds.). World map of the status of human-induced soil degradation: an explanatory note. International Soil Reference and Information Centre (ISRIC), Wageningen, 37.

Ouda, S. A. E., S. G. Mohamed and F. A. Khalil. 2008. Modeling the effect of different stress conditions on maize productivity using yield-stress model. Int. J. Nat. Engg. Sci. 2:57-62.

Parida, A. K. and A. B. Das. 2005. Salt tolerance and salinity effect on plants: A Review. Ecotoxicol. Environ. Safety 60:324-349.

Parvaiz A. and J. Riffat. 2005. Effect of salt stress on growth and biochemical parameters of Pisum sativum L. Arch. Agron. Soil. Sci. 51:665-672.

Pessarakli, M., K. B. Marcum, D. M. Kopec, and Y. L. Qian. 2004. Interactive effects of salinity and primo on the growth of Kentucky bluegrass. The University of Arizona College of Agriculture Turfgrass and Ornamental Research Report. http://cals.arizona.edu/pubs/crops/az1359/

Rodriguez, P., J. Dell’amico, D., Morales. M. J. Sa and N. Blanco. 1997. Effects of salinity on growth, shoot water relations and root hydraulic conductivity in tomato plants. J. Agricultural Sci. 128:439-444.

Shuji, Y., A. B. Ray, and M. H. Paul. 2002. Salt stress tolerance of plants. JIRCAS Working Report: 25-33.

Singh, A. K. and B. Kumari. 2006. Physiological basis of salinity tolerance in rapeseed (Brassica campestris. Var. Toria) during seedling growth. Physiol. Mol. Biol. Plants. 12:167-171.

Sixto, H., J. M Grau, N. Alba and R. Alia. 2005. Response to sodium chloride in different species and clones of genus Populus L. Forestry 78:93-104.

Stuart, F. B., N. T. Phong, and K. S. Wendy. 2000. Effects of salinity on xylem structure and water use in growing leaves of sorghum. New Phytol. 146:119-127.

Tantawy, A. S., A. M. R. Abdel-Mawgoud, M. A. and El-Nemr, Y. G. Chamoun. 2009. Alleviation of salinity effects on tomato plants by application of amino acids and growth regulators. Eur. J. Sci. Res. 30:484-494.

Gokhale M. V., S. V. Toro, S. C. Patil and N. S. Chavan 2008. Effect of vehicular pollution on shoot height and leaf surface structure in Nerium indicum Mill. Bioinfolet, 5:143-144.

Zhang, M., Z. Qiu and X. Liu. 2005. Remote sensed spectral imagery to detect late blight in field tomatoes. Precision Agric. 6:489-508

DEHIDRIN DAN PERANNYA TERHADAP CEKAMAN KEKERINGAN

Muhammad Hatta

PENDAHULUAN

Pertumbuhan tanaman dan produktivitasnya sangat dipengaruhi oleh keadaan alam dalam bentuk berbagai faktor cekaman biotik dan abiotik. Keterbatasan air atau kekeringan merupakan cekaman abiotik yang paling penting di bidang pertanian (Jaleel et al. 2009). Cekaman kekeringan merugikan pertumbuhan tanaman, menurunkan hasil panen dan mengancam kelangsungan hidup tanaman di lapangan (Xoconostle-Cazares et al., 2011; Jaleel et al. 2009). Kerugian hasil panen yang disebabkan oleh kekeringan mungkin melebihi kerugian oleh penyebab lain. Cekaman kekeringan menyebabkan berkurangnya ukuran daun, pemanjangan batang dan proliferasi akar (Farooq et al. 2006).

Secara lingkungan, kekeringan didefinisikan sebagai pasokan air yang tidak mencukupi yang menyebabkan penurunan produksi tanaman. Kekeringan adalah kesenjangan antara kebutuhan tanaman terhadap air dan pasokan air (Blum, 2011). Oleh karena itu, diperlukan upaya untuk mendapatkan tanaman toleransi kekeringan.

clip_image004

Gambar 1. Padi yang mengalami kekeringan parah

Dari berbagai pendekatan yang telah dilakukan untuk mengatasi masalah ini, pemuliaan tanaman, baik yang konvensional maupun yang melibatkan rekayasa genetika adalah cara yang efektif dan ekonomis terhadap lingkungan yang kekurangan air (Ashraf, 2010). Akan tetapi, untuk pelaksanaannya, pendekatan seperti ini membutuhkan dasar pengetahuan pada tingkat struktural dan molekuler, bagaimana kekeringan mempengaruhi tanaman. Selain itu, penanda toleransi kekeringan pada tanaman diperlukan untuk memandu proses pemuliaan tanaman (Vaseva et al., 2012).

Tanaman memersepsi dan merespons dengan cepat perubahan status air dengan perubahan pelbagai morfologi, fisiologis, seluler, dan molekuler yang terjadi secara paralel (Xoconostle-Cazares et al, 2011). Tanaman menampilkan berbagai mekanisme untuk mengatasi cekaman kekeringan. Mekanisme utamanya meliputi pembatasan kehilangan air dengan cara meningkatnya resistensi difusi dan penyerapan air melalui sistem perakaran yang prolifik dan penggunaannya yang efisien, dan daun yang lebih kecil dan sekulen untuk mengurangi transpirasi (Farooq et al. 2006). Pada tingkat fisiologis dan metabolisme, kekeringan menyebabkan penghambatan pertumbuhan tunas, penyesuaian luas daun, dan penutupan stomata, pengurangan transpirasi, penghambatan fotosintesis, pergeseran metabolisme karbon dan nitrogen, sintesis zat terlarut kompatibel, dan cekaman oksidatif sekunder (Xoconostle-Cazares et al, 2011).

Farooq et al. (2006) menjelaskan fenomena yang terjadi pada tanaman yang mengalami cekaman kekeringan. Di antara hara nutrisi, ion kalium membantu dalam penyesuaian osmotik dan silikon meningkatkan silifikasi endodermal akar dan meningkatkan keseimbangan air sel. Osmolit berberat molekul rendah, yang meliputi glycine betaine, prolin dan asam amino lain, asam organik, dan poliol, sangat penting untuk mempertahankan fungsi sel di bawah cekaman kekeringan. Zat pertumbuhan tanaman seperti asam salisilat, auksin, gibberrellins, sitokinin, dan asam absisik memodulasi respons tanaman terhadap kekeringan. Poliamina, citrulline dan beberapa enzim bertindak sebagai antioksidan dan mengurangi efek samping dari kekurangan air. Pada tingkat molekul, beberapa gen responsif-kekeringan dan faktor transkripsi telah diidentifikasi, seperti gen yang mengikat elemen responsif-dehidrasi, aquaporin, protein LEA (late embryogenesis abundant) dan dehidrin.

Cekaman abiotik dengan komponen dehidrasinya (kekeringan, salinitas, dan pembekuan) melibatkan peningkatan jumlah protein tidak aktif seperti terdenaturasi, teragregasi atau rusak oksidatif. Oleh karena itu, mempertahankan protein dalam bentuk fungsional mereka, mencegah agregasi protein, mengembalikan protein rusak menjadi bentuk aslinya dan pembuangan polipeptida non-fungsional dan berpotensi membahayakan adalah penting untuk mempertahankan kelangsungan hidup sel di bawah kondisi dehidrasi. Untuk mencapai hal ini, tanaman merespons kekeringan dengan cara menyintesis protein pelindung, seperti dehidrin atau protein LEA (Vaseva et al., 2012). Akumulasi protein LEA (late embryogenesis abundant) digambarkan sebagai mekanisme yang paling umum dikembangkan tanaman terhadap cekaman kekeringan (Hanin et al., 2011).

clip_image006

Gambar 2. Tanaman ekotipe Lansberg erecta, satu hari pertama disiram dan berikutnya 11 hari tanpa air (Zhang et al. 2008).

PROTEIN LEA

Protein LEA pertama kali dideskripsikan sekitar 25 tahun yang lalu, yang terakumulasi pada akhir perkembangan benih. Protein ini pertama sekali ditemukan pada tanaman kapas. Disebut protein LEA (late embryogenesis abundant), karena protein ini banyak terakumulasi pada tahap akhir dari embriogenesis. Belakangan, protein LEA ditemukan di jaringan vegetatif tanaman pada cekaman lingkungan dan juga pada bakteri dan invetebrata yang toleran desikasi. Meskipun protein LEA secara luas diasumsikan memainkan peran penting dalam toleransi dehidrasi sel, tetapi fungsi fisiologis dan biokimianya tidak diketahui (Hundertmark and Hincha, 2008); Vaseva et al., 2012).

Hundertmark and Hincha (2008) mengidentifikasi 51 gen yang mengkode protein LEA dalam genom Arabidopsis yang dapat diklasifikasikan ke dalam sembilan kelompok yang berbeda. Kebanyakan gen pengkodean protein LEA memiliki elemen ABRE (absisic acid response) dan/ atau LTRE (low emperature response) dalam promotornya dan banyak gen yang mengandung elemen promotornya masing-masing diinduksi oleh asam absisik, suhu rendah atau kekeringan.

clip_image008

Gambar 3. Kelompok protein LEA dan gennya (Hundertmark and Hincha, 2008).

Berdasarkan strukturnya, akumulasi dalam merespons cekaman kekeringan, garam, dan dingin, serta aktivitasnya in vitro, protein LEA dianggap berpartisipasi dalam melindungi komponen sel dari dehidrasi. Protein LEA dicirikan oleh kandungan glisinnya yang relatif tinggi dan hidrofilik dan kandungan struktur sekunder yang rendah. Umumnya, protein LEA tetap cair pada titik didih, yang merupakan properti yang digunakan sebagai langkah awal dalam pemurnianya (Vaseva et al., 2012). Mayoritas protein LEA diperkirakan sangat hidrofilik dan secara alami tidak terstruktur, tetapi beberapa diprediksi terlipat (Hundertmark and Hincha, 2008; A’goston et al. 2011).

Beberapa sistem nomenklatur telah dilaporkan untuk mengklasifikasikan protein LEA. Awalnya, protein LEA diklasifikasikan menurut berat molekulnya dan dengan demikian diberi nama D7, D11, D19, D29, D34, D73, D95, D113. Kemudian, sebagai respons terhadap meningkatnya jumlah protein LEA yang baru diidentifikasi, maka sistem klasifikasi baru diperkenalkan yang berdasarkan pada komposisi asam amino dan urutan motifnya. Protein LEA diklasifikasikan ke dalam enam kelompok oleh sistem nomenklatur yang berbeda atas dasar urutan motifnya. Dehidrin termasuk dalam protein LEA kelompok 2 (Vaseva et al., 2012) atau D11 (Hundertmark and Hincha, 2008)

clip_image010

Gambar 4. Struktur protein (Armstrong, 2006).

clip_image011 clip_image013

Gambar 5. Protein tidak terstruktur (Uversky, 2011).

DEHIDRIN

Dehidrin adalah subkelompok protein Late Embryogenesis Abundant (LEA). Protein ini banyak mendapat perhatian karena paling banyak dipelajari dan dikarakterisasi di bawah cekaman kekeringan. Semua dehidrin mempunyai domain 15-asam amino yang kaya lisin, EKKGIMDKIKEKLPG, yang diberi nama K-segmen dan biasanya hadir di dekat terminal-C. Ciri khas lain dari dehidrin adalah adanya residu Ser (S-segmen), motif konsensus, T/VDEYGNP (Y-segmen) yang terletak dekat N-terminal, dan segmen yang kurang terlindung, biasanya kaya akan asam amino polar (Φ-segmen). Dehidrin tidak memperlihatkan struktur sekunder yang terdefinisi dengan baik (Vaseva et al., 2012).

clip_image015

Gambar 6. Urutan konservatif segmen K, S, dan Y dari dehidrin

Klasifikasi yang berlaku umum dari dehidrin didasarkan pada bangun strukturalnya, seperti adanya urutan konservasinya, yang disebut dengan segmen Y, S dan K. Segmen K, yang merupakan motif 15 asam amino yang sangat konservatif yang membentuk helik amfifilik, sangat penting karena ditemukan di semua dehidrin (Hanin et al., 2012). Jumlah dan urutan segmen-Y, -S, dan -K menentukan sub kelas dehidrin yang berbeda: YnSKn, YnKn, SKN, Kn, dan KNS (Vaseva et al., 2012).

Menurut Hanin et al. 2011, dehidrin merupakan suatu massa molekul yang memiliki bobot antara 9 – 200 kD. Menurut definisi baru yang berdasarkan motifnya, dehidrin adalah protein yang memiliki setidaknya satu copi urutan konservatif, yang disebut dengan segmen-K, di dalam molekulnya. Segmen K adalah urutan asam amino yang kaya lisin (EKK GIM E/DKI KEK LPG), ada 1–11 copi dekat terminal C dari molekul dehidrin. Dehidrin juga memiliki motif lain, yaitu segmen-Y yang kaya tirosin [konsensus (V/T)D(E/Q) YGNP], ada di dekat terminal-N dan segmen-S yang kaya serin yang terbentuk oleh bidang 4 – 10 residu serin, yang merupakan bagian dari urutan konservatif LHRSGS4–10(E/D)3. Segmen-S bisa mengalami fosforilasi oleh enzim kasein kinase 2 (CK2). Menurut keberadaan segmen K, S, dan Y, maka dehidrin dapat dibagi ke dalam 5 subgrup: Kn, SKn, KnS, YnKn and YnSKn. Dalam kondisi cair, dehidrin ada dalam bentuk kumparan. Dehidrin membentuk ikatan hidrogen maksimum dengan molekul air tetangganya (ikatan hidrogen intermolekul) dan ikatan hidrogen minimum di antara residu asam amino yang berbeda (ikatan hidrogen intramolekul). Karena rendahnya proporsi ikatan hidrogen intramolekul, dehidrin terlihat tidak terstruktur dan memiliki banyak kemiripan dengan protein tak terstruktur lainnya (PTT).

Dehidrin mengandung banyak proporsi asam amino hidrofilik dan dapat berubah bentuk sesuai dengan perubahan lingkungan mikronya. Berdasarkan studi lingkungan, menurunnya status hidrasi dehidrin (kehilangan molekul air dalam lingkungan mikronya) atau penambahan sejumlah besar solut kompatibel (spt gliserol), deterjen (spt SDS), atau garam (spt NaCl) ke dalam larutan dehidrin cair, mengarah ke perubahan bentuk yang dapat dimonitor dengan teknik dichroisme sirkulasi UV jauh. Di bawah kondisi hidrasi yang rendah, segmen-K mengadopsi bentuk α-helik yang mirip dengan α-helik amfipatik kelas A2 yang ditemukan pada apolipoprotein dan α-synuclein. Ketika α-helix terbentuk dalam segmen-K, maka terbentuk asam amino yang bermuatan negatif di sisi heliknya, asam amino hidrofobik di sisi oposisi dari heliknya, dan asam amino bermuatan positif pada penghubung polar-non polar (Hanin et al. 2011).

clip_image016

Gambar 7. Karakteristik LEA protein (Nias, 2013).

KEBERADAAN DEHIDRIN DALAM TANAMAN

Dehidrin terdapat pada berbagai organisme termasuk tumbuhan tingkat tinggi,ganggang, ragi dan cyanobacteria. Dehidrin terakumulasi pada fase akhir embriogenesis. Dalam keadaan normal, dehidrin terdapat di dalam beragam bagian sel, seperti sitosol, nukleus, mitokondria, vakuola, dan sekitar membran plasma. Akan tetapi, umumnya, dehidrin banyak terdapat pada sitoplasma dan nukleus (Rorat, 2006)

Pada keadaan stres yang menyebabkan terjadinya dehidrasi, seperti kekeringan, suhu rendah, dan salinitas, dehidrin terinduksi pada hampir di semua jaringan vegetatif (Rorat, 2006). Karena, ekspresi dari banyak dehidrin meningkat oleh kehadiran ABA, maka dehidrin dikenal juga sebagai protein RAB (responsive to ABA)( Hanin et al. 2011).

Penelitian lokalisasi yang ekstensif mengungkapkan bahwa dehidrin terakumulasi pada jaringan dan sel tertentu pada Arabidopsis dalam kondisi pertumbuhan normal. Dehidrin pada Arabidopsis ERD14 dan LTI29 terdeteksi pada ujung akar tanaman yang tumbuh di bawah kondisi normal. ERD14, LTI29 dan RAB18 terekspresi dalam jaringan pembuluh dan RAB18 dalam sel penjaga stomata. Akumulasi ERD14, LTI29 dan RAB18 terdeteksi di sebagian besar sel pada perlakuan cekaman, khususnya dalam sel jaringan sekitar pembuluh. Ditemukan juga bahwa dehidrin LTI30 absen pada tanaman tanpa cekaman, namun terakumulasi pada perlakuan cekaman, terutama pada jaringan pembuluh dan kantung sari, kemungkinan keduanya diatur baik secara transkripsi maupun secara pascatranskripsi (Vaseva et al., 2012).

FUNGSI DEHIDRIN DALAM TANAMAN

Dehidrin menunjukkan fungsi fisiologis pada kondisi pertumbuhan normal dan fungsi khusus dalam respons terhadap beberapa jenis stres. Tripepi et al. (2011) menemukan bahwa ada empat anggota keluarga dehidrin yang terdapat dalam tanaman zaitun dan dua di antaranya berperan dalam stres. Berdasarkan hasil penelitian tersebut, dehidrin diyakini berfungsi sebagai komponen integral dari respons tanaman zaitun terhadap kondisi stres.

Pola ekspresi dari gen dehidrin sering kali berasosiasi dengan sifat tanaman yang bertoleransi tinggi terhadap pendinginan dan kekeringan (Rorat, 2006).

clip_image018

Gambar 8. Perbandingan urutan asam amino pada fragmen dehidrin cowpea. CPR 22 adalah protein yang terinduksi oleh cekaman kekeringan yang diproduksi daun cowpea. MAT1 dan MAT9 adalah protein yang terkait dengan kematangan pada benih kedelai. U10111 adalah protein yang terinduksi oleh cekaman kekeringan pada daun kedelai. Kotak menunjukkan daerah konservasi (Sumber: Ismail et al. 1999)

Menurut Hanin et al. (2011) dehidrin (DHNs), atau kelompok 2 LEA protein, memainkan peranan penting dalam respons tanaman dan adaptasi terhadap cekaman abiotik. Pada umumnya, dehidrin terakumulasi dalam biji yang sedang masak atau terinduksi dalam jaringan vegetatif akibat cekaman salinitas, dehidrasi, suhu dingin, dan beku. Dehidrin menunjukkan beragam fungsi (misalnya, fungsi chaperon, cryoprotektif, antibeku, penangkap radikal bebas, pengikat ion) pada berbagai cekaman, termasuk kekeringan, salinitas, suhu rendah, logam berat, dan mungkin juga terhadap cekaman biotik.

Diduga bahwa dehidrin berinteraksi dengan membran di bagian dalam sel dan mengurangi dehidrasi. Mekanisme interaksi ini dapat dijelaskan oleh kemampuan dehidrin dalam menggantikan air dan mensolvatasi struktur sitosol melalui kelompok hidroksilnya. Penjelasan lain yang mungkin adalah bahwa dehidrin mencegah interaksi antara dua lapis membran atau kemampuannya mengkelat ion, dan mengurangi pengaruh merusak dari tingginya konsentrasi ion (Vaseva et al., 2012).

Fungsi pasti dari dehidrin belum diketahui dengan jelas, tetapi percobaan in vitro menunjukkan bahwa beberapa dehidrin (tipe YSK(n)) mengikat gelembung lipida yang mengandung fospolipida asam, dan dehidrin lain (K9n)S) terlihat mengikat metal dan memiliki kemampuan menangkap radikal hidroksil, melindungi membran lipida terhadap peroksidasi atau memperlihatkan aktivitas karioprotektif terhadap enzim yang sensitif terhadap pembekuan (Rorat, 2006)

Meskipun fungsi dehidrin belum terdiskripsi dengan baik, beberapa mekanisme dehidrin mengatasi cekaman telah diusulkan, seperti membran stabilisasi, ketahanan terhadap cekaman osmotik, dan perlindungan protein – yang disebut dengan fungsi chaperon (Hanin et al. 2011).

Kelihatannya dehidrin memiliki fungsi spesial. Dehidrin mungkin memainkan peran sebagai osmoregulator pada tipe sel tertentu pada saat tidak ada cekaman. Kehadiran dehidrin alami telah dilaporkan pada berbagai spesies tanaman. Contohnya adalah kacang B61 yang merupakan jenis SK2, dan Craterostigma plantagineum DSP16, yang merupakan jenis dehidrin YSK2. Protein mirip dehidrin alami juga telah dilaporkan pada birch (16 kDa), poplar (50 kDa) dan dogwood (60 kDa). Beberapa dehidrin konstitutif juga cekaman-responsif. Misalnya, dehidrin Arabidopsis RAB18 (YSK-type) hadir dalam inti sel penjaga pada kondisi normal, tetapi juga hadir dalam sitosol di bawah cekaman. Demikian pula, aktivitas promotor yang diinduksi cekaman dalam sel penjaga stomata telah dilaporkan pada C. plantagineum DSP16 dan tomat TAS14 yang keduanya juga jenis dehidrin YSK (Vaseva et al., 2012).

Akumulasi lima dehidrin yang diinduksi cekaman pada Arabidopsis (COR47, LTI29, ERD14, LTI30 dan RAB18), setelah perlakuan dengan suhu rendah, ABA, dan konsentrasi garam tinggi, telah dikarakteristik secara imunologis dengan antibodi protein spesifik. Dehidrin menunjukkan perbedaan yang jelas pada pola akumulasinya dalam merespons cekaman yang berbeda. Dehidrin LTI30 tidak terdeteksi pada tanaman tanpa cekaman. ERD14 (SK2) terakumulasi dalam tanaman tanpa cekaman. LTI29 (SK3) terakumulasi terutama pada suhu rendah, tetapi juga ditemukan pada tanaman yang diperlakukan dengan ABA dan garam. LTI30 (K6) dan COR47 (SK3)terakumulasi terutama dalam merespons suhu rendah, sedangkan RAB18 (Y2SK2) hanya ditemukan pada tanaman yang diperlakukan dengan ABA dan merupakan satu-satunya dehidrin dalam penelitian ini yang terakumulasi dalam biji kering (Vaseva et al., 2012).

PERAN DEHIDRIN DALAM CEKAMAN KEKERINGAN

Kekeringan merupakan salah satu cekaman lingkungan yang paling berpengaruh terhadap pertumbuhan dan produktivitas tanaman. Cekaman kekeringan menginduksi beragam respons fisiologi, biokimia, dan molekuler pada tanaman, termasuk perubahan dalam ekspresi gen. Salah satu gen toleran kekeringan adalah gen yang mengkode dehidrin yang termasuk kelompok II atau D-11 dari keluarga LEA protein. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sekuen gen Gm-LEA-D11 yang dimiliki oleh varietas toleran kekeringan dan toleransi moderat berbeda dengan sekuen gen GmLEA-D11 varietas rentan kekeringan (Savitri et al. 2013) dan jumlah protein dehidrin dalam varietas toleran lebih tinggi daripada jumlah protein pada varietas moderat dan sensitif kekeringan (Arumingtyas et al. 2013).

Akumulasi dehidrin pada tanaman merupakan gambaran umum dari respons tanaman terhadap kekeringan. Kendatipun peran dehidrin yang sesungguhnya dalam mengatasi stres kekeringan belum diketahui dengan pasti, namun dari data hasil penelitian, dehidrin memiliki beberapa fungsi seperti fungsi pelindung terhadap protein dan enzim, fungsi pengisi ruang, dan fungsi penangkap spesies oksigen reaktif (ROS) dan pengikat ion logam.

Dehidrin memiliki fungsi pelindung terhadap protein tanaman. Segmen-K dari dehidrin dapat membentuk buntelan ketika dalam bentuk α helik, sehingga meningkatkan karakter amfipatiknya terhadap interaksi protein-protein atau protein-biomembran. Pengikatan dehidrin ke permukaan protein lain yang sebagian mengalami dehidrasi akan meningkatkan pembentukan amphipathic α-heliks dalam molekul dehidrin dan melindungi protein lain dari kehilangan kandungan air lebih lanjut (yang dapat menyebabkan perubahan bentuk protein yang ireversibel yaitu, denaturasi protein). Kemampuan interaksi antara permukaan molekul dehidrin yang sebagian mengalami dehidrasi dengan protein lain atau biomembran merupakan dasar dari fungsi pelindung dehidrin (Hanin et al. 2011). Dehidrin dapat bertindak seperti chaperon terhadap protein lain dan membantu protein tersebut untuk melipat dengan benar atau mencegah protein agregasi di bawah panas atau stres beku (Hanin et al. 2011). Namun demikian, kemampuan seperti chaperon ini didasarkan pada mekanisme “perisai molekul” daripada aktivitas chaperon yang khas. Menurut konsep perisai ini, dehidrin mampu menghambat interaksi antara molekul protein yang terdenaturasi dan mencegah terbentuknya agregat. Adalah sangat mungkin bahwa dehidrin, sebagai mana protein tak teratur umumnya, mampu mengikat molekul mitranya melalui elemen pengenal pendek. Pada saat interaksi ini berlangsung, molekul dehidrin berpartisipasi dalam proses adaptif struktural yang disebut dengan transisi takteratur-ke-teratur atau pelipatan yang diinduksi (Vaseva et al., 2012).

Selain itu, dehidrin dapat berfungsi sebagai pengisi ruang. Ketika sel-sel kehilangan air, maka distribusi kompleks antar sel dapat berubah mengarah kepada interaksi yang tidak diinginkan serta terjadinya agregasi/denaturasi beberapa protein dan kompleks yang terkait dengan membran. Karena dehidrin dapat terakumulasi dalam jumlah yang relatif besar dalam berbagai kompartemen di dalam sel di bawah dehidrasi, maka dehidrin mungkin hanya bertindak sebagai "pengisi-ruang", yaitu mereka dapat berpartisipasi dalam menjaga jarak orisinal dan tidak-berbahaya dari kompleks antar sel. Singkatnya, karena dehidrin tidak bisa dilipat, banyak terakumulasi dan berkemampuan untuk mengikat air, maka dehidrin di bawah kondisi dehidrasi, dapat membantu menjaga volume sel orisinal, sehingga dapat mencegah rusaknya sel (Hanin et al. 2011).

Beberapa dehidrin, yang mengandung relatif banyak H, R, dan residu asam amino reaktif lain pada permukaannya, juga menunjukkan perilaku sebagai penangkap spesies oksigen reaktif (ROS) dan pengikat ion logam. Kedua fungsi ini dimediasi oleh interaksi langsung antara residu asam amino dengan ROS (anion superoksida radikal O2-, singlet oksigen 1O2, radikal hidroksil HO-, Hidrogen peroksida H2O2) atau ion logam (Co2+, Cu2+, Fe2+, Fe3+, Ni2+; Zn2+). Interaksi residu asam amino dengan ROS menyebabkan terjadinya oksidasi residu, sedangkan interaksi dengan ion logam menyebabkan terjadinya pembentukan ikatan kovalen. Pengikatan ion logam bebas mencegah senyawa intraseluler membentuk ROS yang berlebihan karena ion logam bebas dapat bertindak sebagai katalisator sintesis berbagai ROS. Dehidrin juga dapat berfungsi sebagai antioksidan, ion sequestran, atau transporter ion logam dalam cairan floem tanaman (Hanin et al. 2011). Dehidrin dihipotesiskan juga berfungsi untuk menstabilkan makromolekul dalam sel stres. Dehidrin pada jeruk mengurangi peroksidasi lipid dan menangkap radikal hidroksil. Hasil ini menunjukkan bahwa dehidrin jeruk mengikat logam menggunakan urutan spesifik yang mengandung His. Karena dehidrin jeruk adalah protein penangkap radikal, maka ia dapat mengurangi toksisitas logam dalam sel tanaman di bawah kondisi cekaman air (Hara et al. 2005). Lebih lanjut, dilaporkan bahwa dehidrin tipe KS dapat mengurangi pembentukan spesies oksigen reaktif (ROS) dari Cu. AtHIRD11, yang merupakan dehidrin tipe KS Arabidopsis, menghambat pembentukan hidrogen peroksida dan radikal hidroksil dalam sistem Cu-askorbat. Aktivitas penghambatan radikal dari AtHIRD11 lebih kuat dibandingkan aktivitas peptida seperti glutathione dan serum albumin. Penambahan Cu2 + mengurangi keadaan tak-teratur, mengurangi kerentanan tripsin, dan mempromosikan asosiasi diri dari AtHIRD11. Menggunakan 27 peptida yang terkait dengan dehidrin tipe KNS dari 14 spesies tanaman, ditemukan bahwa kekuatan aktivitas penurunan ROS ditentukan oleh dua faktor, yaitu kandungan histidin dan panjang peptida (Hara et al. 2013).

clip_image020

clip_image022

Gambar 9. Model sinyal ABA dan gen protein LEA terhadap stres air (sumber: Nakashima et al., 2011).

DAFTAR PUSTAKA

A´goston, B. S., D. Kova´cs, P. Tompa, and A. Perczel. 2011. Full backbone assignment and dynamics of the intrinsically disordered dehydrin ERD14. Biomol NMR Assign. DOI 10.1007/s12104-011-9297-2

Armstrong, C. 2006. High Protein Diet Facts. http://www.ourhealth.com.au /2006/10/high-protein-diet-facts.html diakses 8-4-2013

Arumingtyas, E. L., E. S. Savitri and R. D. Purwoningrahayu, 2013. "Protein Profiles and Dehydrin Accumulation in Some Soybean Varieties (Glycine max L. Merr) in Drought Stress Conditions," American Journal of Plant Sciences, Vol. 4 No. 1. pp. 134-141. doi: 10.4236/ajps.2013.41018.

Ashraf, M. 2010. Inducing drought tolerance in plants: Recent advances. Biotechnol. Adv. 28, 169-183.

Blum, A. 2011. Breeding for Water-Limited Environments. DOI 10.1007/978-1-4419-7491-4_1, © Springer Science+Business Media, LLC 201. doi:10.1093/jxb/ert016

Hanin, M., F. Brini, C. Ebel,Y. Toda, S. Takeda, and K. Masmoudi. 2011. Plant dehydrins and stress tolerance, versatile proteins for complex mechanisms. Plant Signal Behav. 2011 October; 6(10): 1503–1509.

Hara, M., M. Fujinaga and T. Kuboi. 2005. Metal binding by citrus dehydrin with histidine-rich domains. Journal of Experimental Botany, Vol. 56, No. 420, pp. 2695–2703. doi:10.1093/jxb/eri262

Hara, M., M. Kondo and T. Kato. 2013. A KS-type dehydrin and its related domains reduce Cu-promoted radical generation and the histidine residues contribute to the radical-reducing activities. Journal of Experimental Botany

Ismail, A.M., Anthony E. Hall, and Timoty J. Close. 1999. Purification and partial characterization of a dehydrin involved in chiling tolerance during seedling emergence of cowpea. Plant Physiopogy, vol.120, 237 – 244.

Jaleel C. A., P. Manivannan, A. Wahid, M. Farooq, H. J. Al-Juburi, R. Somasundaram and R. Panneerselvam. 2009. Drought Stress in Plants: A Review on Morphological Characteristics and Pigments Composition. International Journal of Agriculture & Biology. ISSN Print: 1560–8530; ISSN Online: 1814–9596. http://www.fspublishers.org

M. Farooq, A. Wahid, N. Kobayashi, D. Fujita, and S.M.A. Basra. 2006. Plant Drought Stress: Effects, Mechanisms and Management. Cell Mol Biol Lett. 11(4):536-56

Michaela Hundertmark and Dirk K Hincha. 2008. LEA (Late Embryogenesis Abundant) proteins and their encoding genes in Arabidopsis thaliana. BMC Genomics 9:118 doi:10.1186/1471-2164-9-118

Nakashima, K., Y. Fujita and K. Yamaguchi-Shinozaki. 2011. SnRK2 protein kinases are essential for the control of drought tolerance and germination. JIRCAS. Diakses 9-4-2013.

Nias. 2013. LEA Protein and cryptobiosis. http://www.nias.affrc.go.jp /anhydrobiosis/Sleeping%20Chironimid/e-taisei.html. diakses 8-4-2013

Rorat T. 2006. Plant dehydrins–tissue location, structure and function. Cell Mol Biol Lett. 11(4):536-56

Savitri, E. S., N. Basuki, N. Aini, E. L. Arumingtyas. 2013. Identification and characterization drought tolerance of gene LEA-D11 soybean (glycine max L. Merr) based on PCR-sequencing. American Journal of Molecular Biology. 3, 32-37. doi:10.4236/ajmb.2013.31004. http://www.scirp.org /journal/ajmb/

Tripepi, M., M. Pöhlschroder and M. B. Bitonti. 2011. Diversity of Dehydrins in Oleae europaea Plants Exposed to Stress. The Open Plant Science Journal. 5, 9-13

Uversky, V. N.. 2011. Intrinsically disordered proteins from A to Z. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. Volume 43: 1090 – 1103. 2011

Vaseva, I., J. Sabotič, J. Šuštar-Vozlič, V. Meglič, M. Kidrič, K. Demirevska, and L. Simova-Stoilova. 2012. The response of plants to drought stress: The role of dehydrins, chaperones, Proteases and protease inhibitors In maintaining cellular Protein function. 1 – 43. In Droughts: New Research. Editors: D. F. Neves and J. D. Sanz. Nova Science Publishers, Inc.

Xoconostle-Cázares, B., F. A. Ramirez-Ortega, L. Flores-Elenes, and R. Ruiz-Medrano. 2011. Drought tolerance in crop plants. Am. J. Plant Physiol. 5, 241–256.

Zhang, Y., W. Xu, Z. Li, X.W. Deng, W. Wu, and Y. Xue. 2008. F-Box protein DOR functions as a novel inhibitory factor for abscisic acid-induced stomatal closure under drought stress in Arabidpsis. Plant Physiology, Vol. 148: 2121 – 2133. www. Plantphysiol.org /cgi/doi/10.1104/ pp.108.126912

Ikuti

Get every new post delivered to your Inbox.

Bergabunglah dengan 316 pengikut lainnya.